ショートリードシーケンス市場 - 世界の産業規模、シェア、動向、機会、予測、2019年-2029年製品別（装置、消耗品、サービス）、用途別（全ゲノムシーケンス、全エクソームシーケンス、ターゲットシーケンス＆リシーケンス、その他）、エンドユーザー別（学術・研究機関、病院・クリニック、製薬・バイオテクノロジー企業、その他）、地域別、競合別に分類

Short-Read Sequencing Market - Global Industry Size, Share, Trends, Opportunity, and Forecast, 2019-2029 Segmented By Product (Instruments, Consumables, Services), By Application (Whole Genome Sequencing, Whole Exome Sequencing, Targeted Sequencing & Resequencing, Others), By End User (Academic & Research Institutes, Hospitals & Clinics, Pharmaceutical & Biotechnology Companies, Others), By Region and Competition

ショートリードシーケンスの世界市場規模は2023年に54億2000万米ドルとなり、2029年までのCAGRは13.89%で、予測期間中に堅調な成長が予測されています。次世代シーケンサー（NGS）としても知られるショートリード... もっと見る

出版社	出版年月	電子版価格	ページ数	言語
TechSci Research テックサイリサーチ	2024年2月19日	US$4,900 シングルユーザライセンスライセンス・価格情報注文方法はこちら	170	英語

サマリー

ショートリードシーケンスの世界市場規模は2023年に54億2000万米ドルとなり、2029年までのCAGRは13.89%で、予測期間中に堅調な成長が予測されています。次世代シーケンサー（NGS）としても知られるショートリードシーケンサーは、その高いスループット、スピード、費用対効果により、ゲノム研究や臨床診断に革命をもたらしました。この市場には、DNAおよびRNA配列を迅速かつ正確に解読することを目的とした幅広い技術、プラットフォーム、サービスが含まれている。この市場の主要プレーヤーには、イルミナ、サーモフィッシャーサイエンティフィック、オックスフォード・ナノポア・テクノロジーズ、パシフィック・バイオサイエンシズなどが含まれ、それぞれがさまざまな研究・臨床用途に合わせた革新的なシーケンスソリューションを提供している。市場の主な原動力は、個別化医療に対する需要の高まり、ゲノム研究の進歩、世界的な遺伝性疾患やがんの有病率の上昇である。ショートリードシーケンスは、腫瘍学、感染症、生殖医療、農業、法医学などの分野で幅広く応用されており、学術研究機関、製薬会社、臨床研究所、バイオテクノロジー企業などでの採用を促進している。
さらに、シーケンシング化学物質の改良、バイオインフォマティクスツールの強化、ポータブルおよびベンチトップシーケンサーの開発などの技術的進歩が市場成長をさらに後押ししており、シーケンシングソリューションへの幅広いアクセスとスケーラビリティを可能にしている。しかし、データ解析の複雑さ、プロトコルの標準化、ゲノムデータのプライバシーと同意をめぐる倫理的配慮といった課題は、ショートリードシーケンス技術の普及にとって依然として大きなハードルとなっている。それでも、業界関係者、学術機関、規制機関の連携がイノベーションを促進し、こうした課題に対処することで、世界のショートリードシーケンス市場の成長を後押ししています。
主な市場促進要因
ゲノム研究の進展
ゲノム研究の進歩は、世界のショートリードシーケンス市場の成長促進に役立っています。ゲノム研究の分野は、技術革新と疾患の遺伝的基盤の深い理解に後押しされ、近年著しい変貌を遂げています。次世代シーケンサー（NGS）としても知られるショートリードシーケンサーは、この革命の最前線に位置し、高いスループットと精度でDNAおよびRNA配列を解読する前例のない能力を提供しています。
ゲノム研究の進展がショートリードシーケンス市場を押し上げる鍵の1つは、シーケンス技術に対する需要の増加である。研究者がヒトゲノムの複雑さと健康や病気におけるその役割を深く掘り下げるにつれて、大量の遺伝子データを効率的に解析できるハイスループットシーケンスプラットフォームに対するニーズが高まっています。ショートリードシーケンス技術は、ゲノムワイド解析のための迅速かつコスト効率の高いソリューションを提供することで、このニーズを満たし、研究者が多様な研究課題や仮説を探求することを可能にします。
さらに、ゲノム研究の進歩により、新規遺伝子マーカー、バイオマーカー、治療標的が同定され、ショートリードシーケンス技術の採用がさらに推進されています。異なる疾患や表現型を持つ個人のゲノムをシーケンスすることで、研究者は特定の形質や状態に関連する遺伝的変異を突き止めることができます。この情報は、疾病メカニズムの理解、潜在的な創薬標的の特定、個別化治療戦略の開発にとって非常に貴重です。精密医療の需要が拡大し続ける中、ゲノムプロファイリングと分子診断を容易にするショートリードシーケンス技術の需要も高まっている。
さらに、ゲノム研究の進展がシーケンス技術自体の技術革新を促進しています。研究者や業界関係者はシーケンシング技術の限界を常に押し広げ、シーケンシングの性能と能力を向上させる新しい化学物質、装置、バイオインフォマティクスツールを開発しています。これらの技術革新は、ショートリードシーケンスの精度と効率を向上させるだけでなく、コストを削減し、アクセス性を高めることで、世界中の研究者や臨床医がシーケンス技術をより広く利用できるようにしています。
遺伝性疾患とがんの有病率の上昇
遺伝性疾患とがんの有病率が世界的に上昇していることが、世界のショートリードシーケンス市場を大きく押し上げています。個人のDNAの異常を特徴とする遺伝性疾患は、希少遺伝性疾患、遺伝性疾患、染色体異常など、幅広い疾患を包含しています。同様に、制御不能な細胞増殖を特徴とする複雑な遺伝病であるがんは、世界的に罹患率および死亡率の主要な原因となっています。遺伝性疾患やがんの発生率が上昇を続ける中、正確で包括的なゲノム解析に対する需要が高まっており、ショートリードシーケンス技術の採用を後押ししています。
ショートリードシーケンスは、DNAおよびRNA配列のハイスループット解析を可能にすることで、遺伝性疾患やがんの診断、予後、治療に重要な役割を果たしています。患者のゲノムやトランスクリプトームの配列を決定することで、研究者や臨床医は特定の疾患やがんのサブタイプに関連する遺伝子変異、構造変異、遺伝子発現パターンを特定することができます。この情報は、疾患メカニズムの理解、疾患の進行予測、個々の患者に合わせた個別化治療戦略の指針として非常に貴重である。
さらに、ショートリードシーケンス技術は、実用的な変異や治療標的の同定を容易にし、遺伝性疾患やがんの管理における精密医療アプローチへの道を開く。ゲノムプロファイルに基づいて患者を標的療法や臨床試験に適合させることで、ショートリードシーケンス技術は治療結果を改善し、副作用を軽減することができます。さらに、シーケンス技術により、疾患の進行や治療反応を長期にわたってモニタリングできるため、臨床医は必要に応じて治療レジメンを調整することができます。
遺伝性疾患やがんの有病率の上昇も、早期発見と予防戦略の重要性を強調しており、ショートリードシーケンス技術の需要をさらに押し上げています。特定の疾患に関連する遺伝的素因やリスク因子をスクリーニングすることで、シーケンス技術はリスクのある集団を特定し、早期介入や予防措置を促進することができます。例えば、ショートリードシーケンスを用いたキャリアスクリーニングは、遺伝性疾患を子孫に引き継ぐリスクのある個人を特定し、情報に基づいた生殖に関する決定を可能にします。
シーケンスプラットフォームにおける技術の進歩
シーケンシングプラットフォームの技術的進歩は、世界のショートリードシーケンシング市場を押し上げる上で極めて重要な役割を果たしています。次世代シーケンサー（NGS）としても知られるショートリードシーケンサーは、装置、化学、データ解析パイプラインの技術革新によって急速な進化を遂げています。これらの進歩は、シーケンスプラットフォームの性能と能力を向上させただけでなく、入手しやすさ、手頃な価格、使いやすさを向上させ、市場の成長に拍車をかけています。
世界のショートリードシーケンス市場を牽引する主要な技術進歩の1つは、新規のシーケンスケミストリーとプラットフォームの開発です。各社はシーケンスの精度、リード長、スループットを向上させるための技術革新を継続的に進めており、研究者はより高品質なゲノムデータを高速かつ低コストで作成できるようになっています。例えば、ナノポアシーケンス技術の進歩は、最小限のサンプル前処理でリアルタイムの単一分子シーケンスを可能にし、この分野に革命をもたらしました。同様に、シークエンシング・バイ・シンセシス技術の向上により、1回の実行で数十億リードを生成できるハイスループットシーケンスプラットフォームが開発されました。
さらに、装置スループットの進歩により、ショートリードシーケンス技術のスケーラビリティと効率が大幅に向上しました。最新のシーケンスプラットフォームは複数のサンプルを同時に処理できるため、研究者は大規模コホートの解析やハイスループットスクリーニング実験を容易に行うことができます。このスケーラビリティは、大量のサンプルを迅速に処理する能力が不可欠な大規模ゲノム研究、集団遺伝学研究、臨床診断に特に有益です。
シーケンス化学および装置の改良に加え、バイオインフォマティクスツールおよびデータ解析パイプラインの進歩が、ショートリードのシーケンスプラットフォームで生成されたゲノムデータの解釈と活用を容易にすることで、市場の成長を促進しています。ゲノムデータの量と複雑性が増加し続ける中、大規模なデータセットを扱い、遺伝子変異を同定し、意味のある洞察を抽出できる高度なバイオインフォマティクスソリューションに対するニーズが高まっている。各社は、研究者や臨床医がゲノムデータを効率的に解析、注釈付け、解釈できるようにするユーザーフレンドリーなバイオインフォマティクス・プラットフォームやソフトウェアパッケージを開発し、科学的発見や臨床上の意思決定を加速させている。
主な市場課題
データ解析の複雑性
世界のショートリードシーケンス市場を阻害する主な課題の1つは、データ解析の複雑さです。大量のゲノムデータの生成は最初の一歩に過ぎず、このデータの解析と解釈には大きな課題があります。ショートリードシーケンスでは膨大な量の生のシーケンスデータが生成され、高度なバイオインフォマティクスツールやアルゴリズムを用いて処理、アライメント、解析する必要があります。反復配列、構造変異、シーケンスエラーなど、ゲノムデータの複雑さはデータ解析と解釈を複雑にし、高度な計算技術と専門知識を必要とします。この課題に対処するには、バイオインフォマティクス研究への継続的な投資と、データ処理を合理化し、ゲノム解析の精度と効率を高める使いやすい解析ツールの開発が必要である。
プロトコルの標準化
世界のショートリードシーケンス市場が直面するもう1つの主要な課題は、プロトコールとワークフローの標準化が進んでいないことです。シーケンスプラットフォーム、ライブラリー調製法、データ解析パイプラインが異なると結果が異なる可能性があり、研究やラボ間でデータを比較することが難しくなります。ゲノムデータの再現性、信頼性、比較可能性を確保するためには、サンプル調製、シーケンス、データ解析のプロトコルを標準化することが不可欠である。ショートリードシーケンス技術の標準化されたプロトコル、ガイドライン、品質管理手段を確立するためには、業界関係者、規制機関、研究コミュニティ間の協力的な取り組みが必要である。さらに、熟練度試験や外部品質評価プログラムなどのイニシアチブは、シーケンスプロトコルを検証し、異なるプラットフォームやラボ間で一貫した性能を保証するのに役立ちます。
倫理的配慮とデータプライバシー
ゲノムデータのプライバシーと同意をめぐる倫理的配慮は、Short Read Sequencingの世界市場にとって大きな課題となっています。ゲノムデータには、個人の遺伝的体質、疾病の素因、家族関係に関するセンシティブな情報が含まれているため、データのプライバシー、セキュリティ、悪用の可能性に関する懸念が生じます。インフォームドコンセントを確保し、患者の秘密を守り、ゲノムデータを不正アクセスや開示から保護することが最も重要です。欧州では一般データ保護規則（GDPR）、米国では医療保険の相互運用性と説明責任に関する法律（HIPAA）など、ゲノムデータの収集、保存、共有に関する規制の枠組みやガイドラインを遵守しなければならない。さらに、倫理的な懸念に対処し、患者、研究者、ショートリードシーケンス市場の関係者の間で信頼を築くには、データ取り扱い方法の透明性、堅牢なデータ暗号化手法、安全なデータ保管インフラが不可欠である。
主な市場動向
腫瘍学研究の進展
腫瘍学研究の進歩は、世界のショートリードシーケンス市場を押し上げる上で重要な役割を果たしています。複雑な遺伝病であるがんは、診断、治療、患者管理において独特の課題をもたらします。しかし、最近の腫瘍学研究における飛躍的な進歩は、ショートリードシーケンス技術の進歩と相まって、がんの生物学と治療戦略に対する理解を大きく変えました。次世代シーケンサー（NGS）としても知られるショートリードシーケンス技術は、がん研究において不可欠なツールとして台頭してきた。これらのプラットフォームは腫瘍の包括的なゲノムプロファイリングを可能にし、研究者や臨床医に、がんの発生、進行、治療抵抗性を引き起こす遺伝子変化に関する貴重な洞察を提供する。がん細胞のゲノムをシーケンスすることで、ショートリードシーケンス技術は、特定のがん種やサブタイプに関連する体細胞変異、コピー数の変動、遺伝子発現パターンを同定することができる。
腫瘍学研究の進歩が世界のショートリードシーケンス市場を押し上げる主な方法の1つは、新規治療標的の発見です。ショートリードシーケンス技術を用いた腫瘍のゲノムプロファイリングにより、精密治療で標的とすることができる実用的な変異や分子経路が同定されています。例えば、非小細胞肺がん（NSCLC）におけるEGFRのようながん原性ドライバー変異の発見は、チロシンキナーゼ阻害剤（TKI）のような標的療法開発の道を開き、EGFR変異NSCLC患者の転帰を大幅に改善した。
さらに、腫瘍学研究の進歩により、治療効果や予後を予測するための新規バイオマーカーが開発されている。ショートリードシーケンス技術により、研究者はマイクロサテライト不安定性（MSI）や腫瘍変異負荷（TMB）などの予測バイオマーカーを同定することが可能となり、治療方針の決定や治療に対する奏効の可能性に基づく患者の層別化に役立てることができる。さらに、ショートリードシーケンスを用いた腫瘍のゲノムプロファイリングにより、治療抵抗性のメカニズムが明らかになり、抵抗性を克服して患者の転帰を改善するための新たな治療戦略の開発に情報を提供することができる。
さらに、腫瘍学研究の進歩が、臨床診断におけるショートリードシーケンス技術の採用を後押ししています。ショートリードシーケンスによる腫瘍のゲノムプロファイリングは、精密腫瘍学的アプローチに情報を提供し、臨床医がゲノムプロファイルに基づいて個々の患者に治療レジメンを調整することを可能にします。精密医療が腫瘍学で牽引し続ける中、臨床診断におけるショートリードシーケンス技術の需要は拡大し、市場の成長と技術革新を促進すると予想される。
非臨床分野での応用拡大
世界のショートリードシーケンス市場は、非臨床分野での応用拡大により大きな盛り上がりを見せています。ショートリードシーケンス技術は従来、ゲノム研究や臨床診断に関連してきましたが、その汎用性と拡張性により、農業、法医学、環境モニタリングなどの非臨床分野で新たな機会が生まれています。農業分野では、ショートリードシーケンスが作物の改良、家畜の品種改良、食品安全性検査に革命をもたらしている。動植物のゲノムをシーケンスすることで、研究者は収量、耐病性、栄養成分などの望ましい形質に関連する遺伝的変異を特定することができます。この情報は、改良作物品種や家畜品種の開発を目的とした育種プログラムにとって非常に貴重です。さらに、ショートリードシーケンス技術により、食品中の病原体や汚染物質を迅速かつ正確に検出できるため、食品の安全性と品質管理が保証されます。
科学捜査の分野では、DNAプロファイリングと同定を目的としてショートリードシーケンスが利用されています。ショートリードシーケンス技術は、毛髪、血液、唾液などの法医学サンプルから微量のDNAを解析することができ、犯罪捜査や個人の特定に役立つ貴重な遺伝情報を提供します。さらに、ショートリードシーケンスにより、複雑なDNA混合物や劣化したサンプルの分析が可能になり、法医学分析の精度と信頼性が向上します。
さらに、環境モニタリングや生物多様性保全の取り組みにおいても、ショートリードシーケンス技術の応用が進んでいます。土壌、水、大気サンプルから環境DNA（eDNA）をシーケンスすることで、研究者は生物多様性を評価し、生態系の健全性をモニタリングし、侵入種や病原体を検出することができます。ショートリードシーケンスにより、eDNAサンプルのハイスループット解析が可能になり、微生物群集、種の構成、生態学的相互作用に関する知見が得られます。この情報は、保全活動、生息地の回復、天然資源の管理に不可欠です。非臨床分野におけるアプリケーションの拡大が、ショートリードシーケンス技術の需要を押し上げ、市場成長の原動力となっています。ショートリードシーケンスプラットフォームの汎用性と拡張性が向上し続ける中、農業、法医学、環境モニタリングにおけるこれらの技術の採用はさらに加速すると予想される。
セグメント別インサイト
製品別インサイト
製品に基づくと、2023年の世界のショートリードシーケンス市場では、消耗品セグメントが支配的なセグメントに浮上しました。試薬、キット、カートリッジなどの消耗品は、ショートリードシーケンス実験の実施に必要不可欠なコンポーネントです。これらの消耗品は、サンプル調製、ライブラリー構築、シーケンス反応中に大量に消費されるため、ゲノム解析を行う研究者やラボにとって不可欠なものとなっています。ゲノム研究、臨床診断、非臨床分野など、さまざまな用途でショートリードシーケンス技術の採用が増加していることが、消耗品の需要を促進しています。
アプリケーションの洞察
アプリケーションに基づくと、ターゲットシーケンス＆リシーケンスセグメントが2023年の世界のショートリードシーケンス市場で支配的なセグメントとして浮上しました。ターゲットシーケンスにより、特定の疾患や状態に関連する遺伝子変異、突然変異、バイオマーカーの同定が可能になり、臨床医がゲノムプロファイルに基づいて個々の患者に治療戦略を調整できるようになる。精密医療が腫瘍学、希少疾患、薬理ゲノミクスなどさまざまな治療領域で普及するにつれて、標的シーケンスおよび再シーケンス技術に対する需要は増加の一途をたどっています。
地域別の洞察
北米は2023年に世界のショートリードシーケンス市場の支配的なプレーヤーとして浮上し、最大の市場シェアを占めました。北米はゲノム研究開発のための強固なインフラを誇り、主要な学術機関、研究センター、バイオテクノロジー企業が集中してショートリードシーケンス分野の技術革新を推進しています。この地域には、Illumina、Thermo Fisher Scientific、Pacific Biosciencesといった著名なシーケンス技術プロバイダーが存在し、シーケンスプラットフォームやアプリケーションの進歩の先頭に立ち続けています。また、ゲノミクス研究や精密医療への取り組みに対する有利な政府の取り組みや資金援助が、世界のショートリードシーケンス市場における北米の優位性に寄与しています。
主要市場プレイヤー
- イルミナ社
- Invitae Corporation
- サーモフィッシャーサイエンティフィック社
- Pacific Biosciences of California, Inc.
- BGIジェノミクス株式会社
- QIAGEN NV
- アジレント・テクノロジー
- アゼンタUS社（GENEWIZ）
- パーキンエルマー社
- ProPhase Labs, Inc. (Nebula Genomics)
レポートの範囲
本レポートでは、ショートリードシーケンスの世界市場を、以下に詳述する業界動向に加えて、以下のカテゴリーに分類しています：
- ショートリードシーケンスの世界市場、製品別
機器
o 消耗品
o サービス
- ショートリードシーケンスの世界市場、用途別
o 全ゲノムシーケンス
全エクソームシーケンス
o ターゲットシーケンスおよびリシーケンス
o その他
- ショートリードシーケンスの世界市場：エンドユーザー別
o 学術・研究機関
o 病院・クリニック
o 製薬・バイオテクノロジー企業
o その他
- ショートリードシーケンスの世界市場：地域別
o 北米
 米国
 カナダ
 メキシコ
欧州
 フランス
 イギリス
 イタリア
 ドイツ
 スペイン
o アジア太平洋
 中国
 インド
 日本
 オーストラリア
 韓国
南米
 ブラジル
 アルゼンチン
 コロンビア
o 中東・アフリカ
 南アフリカ
 サウジアラビア
 UAE
競争環境
企業プロフィール：世界のショートリードシーケンス市場に存在する主要企業の詳細分析。
利用可能なカスタマイズ
Tech Sci Research社は、与えられた市場データをもとに、ショートリードシーケンスの世界市場レポートにおいて、企業固有のニーズに応じたカスタマイズを提供しています。このレポートでは以下のカスタマイズが可能です：
企業情報
- 追加市場参入企業（最大5社）の詳細分析とプロファイリング

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1. Product Overview
1.1. Market Definition
1.2. Scope of the Market
1.2.1. Markets Covered
1.2.2. Years Considered for Study
1.2.3. Key Market Segmentations
2. Research Methodology
2.1. Objective of the Study
2.2. Baseline Methodology
2.3. Key Industry Partners
2.4. Major Association and Secondary Sources
2.5. Forecasting Methodology
2.6. Data Triangulation & Validation
2.7. Assumptions and Limitations
3. Executive Summary
3.1. Overview of the Market
3.2. Overview of Key Market Segmentations
3.3. Overview of Key Market Players
3.4. Overview of Key Regions/Countries
3.5. Overview of Market Drivers, Challenges, Trends
4. Global Short-Read Sequencing Market Outlook
4.1. Market Size & Forecast
4.1.1. By Value
4.2. Market Share & Forecast
4.2.1. By Product (Instruments, Consumables, Services)
4.2.2. By Application (Whole Genome Sequencing, Whole Exome Sequencing, Targeted Sequencing & Resequencing, Others)
4.2.3. By End User (Academic & Research Institutes, Hospitals & Clinics, Pharmaceutical & Biotechnology Companies, Others)
4.2.4. By Region
4.2.5. By Company (2023)
4.3. Market Map
5. Asia Pacific Short-Read Sequencing Market Outlook
5.1. Market Size & Forecast
5.1.1. By Value
5.2. Market Share & Forecast
5.2.1. By Product
5.2.2. By Application
5.2.3. By End User
5.2.4. By Country
5.3. Asia Pacific: Country Analysis
5.3.1. China Short-Read Sequencing Market Outlook
5.3.1.1. Market Size & Forecast
5.3.1.1.1. By Value
5.3.1.2. Market Share & Forecast
5.3.1.2.1. By Product
5.3.1.2.2. By Application
5.3.1.2.3. By End User
5.3.2. India Short-Read Sequencing Market Outlook
5.3.2.1. Market Size & Forecast
5.3.2.1.1. By Value
5.3.2.2. Market Share & Forecast
5.3.2.2.1. By Product
5.3.2.2.2. By Application
5.3.2.2.3. By End User
5.3.3. Australia Short-Read Sequencing Market Outlook
5.3.3.1. Market Size & Forecast
5.3.3.1.1. By Value
5.3.3.2. Market Share & Forecast
5.3.3.2.1. By Product
5.3.3.2.2. By Application
5.3.3.2.3. By End User
5.3.4. Japan Short-Read Sequencing Market Outlook
5.3.4.1. Market Size & Forecast
5.3.4.1.1. By Value
5.3.4.2. Market Share & Forecast
5.3.4.2.1. By Product
5.3.4.2.2. By Application
5.3.4.2.3. By End User
5.3.5. South Korea Short-Read Sequencing Market Outlook
5.3.5.1. Market Size & Forecast
5.3.5.1.1. By Value
5.3.5.2. Market Share & Forecast
5.3.5.2.1. By Product
5.3.5.2.2. By Application
5.3.5.2.3. By End User
6. Europe Short-Read Sequencing Market Outlook
6.1. Market Size & Forecast
6.1.1. By Value
6.2. Market Share & Forecast
6.2.1. By Product
6.2.2. By Application
6.2.3. By End User
6.2.4. By Country
6.3. Europe: Country Analysis
6.3.1. France Short-Read Sequencing Market Outlook
6.3.1.1. Market Size & Forecast
6.3.1.1.1. By Value
6.3.1.2. Market Share & Forecast
6.3.1.2.1. By Product
6.3.1.2.2. By Application
6.3.1.2.3. By End User
6.3.2. Germany Short-Read Sequencing Market Outlook
6.3.2.1. Market Size & Forecast
6.3.2.1.1. By Value
6.3.2.2. Market Share & Forecast
6.3.2.2.1. By Product
6.3.2.2.2. By Application
6.3.2.2.3. By End User
6.3.3. Spain Short-Read Sequencing Market Outlook
6.3.3.1. Market Size & Forecast
6.3.3.1.1. By Value
6.3.3.2. Market Share & Forecast
6.3.3.2.1. By Product
6.3.3.2.2. By Application
6.3.3.2.3. By End User
6.3.4. Italy Short-Read Sequencing Market Outlook
6.3.4.1. Market Size & Forecast
6.3.4.1.1. By Value
6.3.4.2. Market Share & Forecast
6.3.4.2.1. By Product
6.3.4.2.2. By Application
6.3.4.2.3. By End User
6.3.5. United Kingdom Short-Read Sequencing Market Outlook
6.3.5.1. Market Size & Forecast
6.3.5.1.1. By Value
6.3.5.2. Market Share & Forecast
6.3.5.2.1. By Product
6.3.5.2.2. By Application
6.3.5.2.3. By End User
7. North America Short-Read Sequencing Market Outlook
7.1. Market Size & Forecast
7.1.1. By Value
7.2. Market Share & Forecast
7.2.1. By Product
7.2.2. By Application
7.2.3. By End User
7.2.4. By Country
7.3. North America: Country Analysis
7.3.1. United States Short-Read Sequencing Market Outlook
7.3.1.1. Market Size & Forecast
7.3.1.1.1. By Value
7.3.1.2. Market Share & Forecast
7.3.1.2.1. By Product
7.3.1.2.2. By Application
7.3.1.2.3. By End User
7.3.2. Mexico Short-Read Sequencing Market Outlook
7.3.2.1. Market Size & Forecast
7.3.2.1.1. By Value
7.3.2.2. Market Share & Forecast
7.3.2.2.1. By Product
7.3.2.2.2. By Application
7.3.2.2.3. By End User
7.3.3. Canada Short-Read Sequencing Market Outlook
7.3.3.1. Market Size & Forecast
7.3.3.1.1. By Value
7.3.3.2. Market Share & Forecast
7.3.3.2.1. By Product
7.3.3.2.2. By Product Type
7.3.3.2.3. By End User
8. South America Short-Read Sequencing Market Outlook
8.1. Market Size & Forecast
8.1.1. By Value
8.2. Market Share & Forecast
8.2.1. By Product
8.2.2. By Application
8.2.3. By End User
8.2.4. By Country
8.3. South America: Country Analysis
8.3.1. Brazil Short-Read Sequencing Market Outlook
8.3.1.1. Market Size & Forecast
8.3.1.1.1. By Value
8.3.1.2. Market Share & Forecast
8.3.1.2.1. By Product
8.3.1.2.2. By Application
8.3.1.2.3. By End User
8.3.2. Argentina Short-Read Sequencing Market Outlook
8.3.2.1. Market Size & Forecast
8.3.2.1.1. By Value
8.3.2.2. Market Share & Forecast
8.3.2.2.1. By Product
8.3.2.2.2. By Application
8.3.2.2.3. By End User
8.3.3. Colombia Short-Read Sequencing Market Outlook
8.3.3.1. Market Size & Forecast
8.3.3.1.1. By Value
8.3.3.2. Market Share & Forecast
8.3.3.2.1. By Product
8.3.3.2.2. By Application
8.3.3.2.3. By End User
9. Middle East and Africa Short-Read Sequencing Market Outlook
9.1. Market Size & Forecast
9.1.1. By Value
9.2. Market Share & Forecast
9.2.1. By Product
9.2.2. By Application
9.2.3. By End User
9.2.4. By Country
9.3. MEA: Country Analysis
9.3.1. South Africa Short-Read Sequencing Market Outlook
9.3.1.1. Market Size & Forecast
9.3.1.1.1. By Value
9.3.1.2. Market Share & Forecast
9.3.1.2.1. By Product
9.3.1.2.2. By Application
9.3.1.2.3. By End User
9.3.2. Saudi Arabia Short-Read Sequencing Market Outlook
9.3.2.1. Market Size & Forecast
9.3.2.1.1. By Value
9.3.2.2. Market Share & Forecast
9.3.2.2.1. By Product
9.3.2.2.2. By Application
9.3.2.2.3. By End User
9.3.3. UAE Short-Read Sequencing Market Outlook
9.3.3.1. Market Size & Forecast
9.3.3.1.1. By Value
9.3.3.2. Market Share & Forecast
9.3.3.2.1. By Product
9.3.3.2.2. By Application
9.3.3.2.3. By End User
10. Market Dynamics
10.1. Drivers
10.2. Challenges
11. Market Trends & Developments
11.1. Recent Developments
11.2. Product Launches
11.3. Mergers & Acquisitions
12. Global Short-Read Sequencing Market: SWOT Analysis
13. Porter’s Five Forces Analysis
13.1. Competition in the Industry
13.2. Potential of New Entrants
13.3. Power of Suppliers
13.4. Power of Customers
13.5. Threat of Substitute Product
14. Competitive Landscape
14.1. Illumina, Inc.
14.1.1. Business Overview
14.1.2. Company Snapshot
14.1.3. Products & Services
14.1.4. Financials (As Reported)
14.1.5. Recent Developments
14.1.6. Key Personnel Details
14.1.7. SWOT Analysis
14.2. Invitae Corporation
14.3. Thermo Fisher Scientific, Inc.
14.4. Pacific Biosciences of California, Inc.
14.5. BGI Genomics Co., Ltd
14.6. QIAGEN NV
14.7. Agilent Technologies
14.8. Azenta US, Inc. (GENEWIZ)
14.9. PerkinElmer, Inc.
14.10. ProPhase Labs, Inc. (Nebula Genomics)
15. Strategic Recommendations
16. About Us & Disclaimer

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Table of Contents

Summary

Global Short-Read Sequencing Market was valued at USD 5.42 Billion in 2023 and is anticipated to project robust growth in the forecast period with a CAGR of 13.89% through 2029. Short read sequencing, also known as next-generation sequencing (NGS), has revolutionized genomic research and clinical diagnostics due to its high throughput, speed, and cost-effectiveness. This market encompasses a wide array of technologies, platforms, and services aimed at deciphering DNA and RNA sequences quickly and accurately. Key players in this market include Illumina, Thermo Fisher Scientific, Oxford Nanopore Technologies, and Pacific Biosciences, among others, each offering innovative sequencing solutions tailored to various research and clinical applications. The market is primarily driven by the increasing demand for personalized medicine, advancements in genomic research, and the rising prevalence of genetic disorders and cancers worldwide. Short read sequencing finds extensive applications in fields such as oncology, infectious diseases, reproductive health, agriculture, and forensics, driving its adoption across academic research institutions, pharmaceutical companies, clinical laboratories, and biotechnology firms.
Moreover, technological advancements such as improved sequencing chemistries, enhanced bioinformatics tools, and the development of portable and benchtop sequencers are further fueling market growth, enabling broader accessibility and scalability of sequencing solutions. However, challenges such as data analysis complexities, standardization of protocols, and ethical considerations surrounding genomic data privacy and consent remain significant hurdles in the widespread adoption of short read sequencing technologies. Nonetheless, collaborations between industry players, academic institutions, and regulatory bodies are fostering innovation and addressing these challenges, thereby propelling the growth of the global short read sequencing market.
Key Market Drivers
Advancements in Genomic Research
Advancements in genomic research have been instrumental in driving the growth of the Global Short Read Sequencing Market. The field of genomics has undergone a remarkable transformation in recent years, fueled by technological innovations and a deeper understanding of the genetic basis of diseases. Short read sequencing, also known as next-generation sequencing (NGS), lies at the forefront of this revolution, offering unprecedented capabilities for deciphering DNA and RNA sequences with high throughput and accuracy.
One of the keyways in which advancements in genomic research boost the short read sequencing market is by increasing the demand for sequencing technologies. As researchers delve deeper into the complexities of the human genome and its role in health and disease, there is a growing need for high-throughput sequencing platforms that can efficiently analyze large volumes of genetic data. Short read sequencing technologies fulfill this need by providing rapid and cost-effective solutions for genome-wide analysis, enabling researchers to explore diverse research questions and hypotheses.
Moreover, advancements in genomic research have led to the identification of novel genetic markers, biomarkers, and therapeutic targets, further driving the adoption of short read sequencing technologies. By sequencing the genomes of individuals with different diseases or phenotypes, researchers can pinpoint genetic variations associated with specific traits or conditions. This information is invaluable for understanding disease mechanisms, identifying potential drug targets, and developing personalized treatment strategies. As the demand for precision medicine continues to grow, so does the demand for short read sequencing technologies that can facilitate genomic profiling and molecular diagnostics.
Furthermore, advancements in genomic research are driving innovation in sequencing technologies themselves. Researchers and industry players are constantly pushing the boundaries of sequencing technology, developing new chemistries, instrumentation, and bioinformatics tools to enhance sequencing performance and capabilities. These innovations not only improve the accuracy and efficiency of short read sequencing but also reduce costs and increase accessibility, making sequencing technologies more widely available to researchers and clinicians around the world.
Rising Prevalence of Genetic Disorders and Cancers
The rising prevalence of genetic disorders and cancers worldwide is significantly boosting the Global Short Read Sequencing Market. Genetic disorders, characterized by abnormalities in an individual's DNA, encompass a wide range of conditions, including rare genetic diseases, hereditary disorders, and chromosomal abnormalities. Similarly, cancer, a complex genetic disease characterized by uncontrolled cell growth, is a leading cause of morbidity and mortality globally. As the incidence of genetic disorders and cancers continues to rise, there is an increasing demand for accurate and comprehensive genomic analysis, driving the adoption of short read sequencing technologies.
Short read sequencing plays a critical role in the diagnosis, prognosis, and treatment of genetic disorders and cancers by enabling high-throughput analysis of DNA and RNA sequences. By sequencing the genomes or transcriptomes of patients, researchers and clinicians can identify genetic mutations, structural variants, and gene expression patterns associated with specific diseases or cancer subtypes. This information is invaluable for understanding disease mechanisms, predicting disease progression, and guiding personalized treatment strategies tailored to individual patients.
Moreover, short read sequencing technologies facilitate the identification of actionable mutations and therapeutic targets, paving the way for precision medicine approaches in the management of genetic disorders and cancers. By matching patients with targeted therapies or clinical trials based on their genomic profiles, short read sequencing technologies can improve treatment outcomes and reduce adverse effects. Additionally, sequencing technologies enable the monitoring of disease progression and treatment response over time, allowing clinicians to adjust treatment regimens as needed.
The rising prevalence of genetic disorders and cancers also underscores the importance of early detection and prevention strategies, further driving the demand for short read sequencing technologies. By screening individuals for genetic predispositions or risk factors associated with certain diseases, sequencing technologies can identify at-risk populations and facilitate early intervention or preventive measures. For example, carrier screening using short read sequencing can identify individuals at risk of passing on genetic disorders to their offspring, enabling informed reproductive decisions.
Technological Advancements in Sequencing Platforms
Technological advancements in sequencing platforms are playing a pivotal role in boosting the Global Short Read Sequencing Market. Short read sequencing, also known as next-generation sequencing (NGS), has undergone rapid evolution, driven by innovations in instrumentation, chemistry, and data analysis pipelines. These advancements have not only improved the performance and capabilities of sequencing platforms but also enhanced their accessibility, affordability, and usability, thereby fueling market growth.
One of the key technological advancements driving the global short read sequencing market is the development of novel sequencing chemistries and platforms. Companies are continuously innovating to improve sequencing accuracy, read lengths, and throughput, enabling researchers to generate higher-quality genomic data at faster speeds and lower costs. For example, advancements in nanopore sequencing technology have revolutionized the field by enabling real-time, single-molecule sequencing with minimal sample preparation requirements. Similarly, improvements in sequencing-by-synthesis techniques have led to the development of high-throughput sequencing platforms capable of generating billions of reads in a single run.
Furthermore, advancements in instrument throughput have significantly increased the scalability and efficiency of short read sequencing technologies. Modern sequencing platforms can process multiple samples simultaneously, allowing researchers to analyze large cohorts or conduct high-throughput screening experiments with ease. This scalability is particularly beneficial for large-scale genomic studies, population genetics research, and clinical diagnostics, where the ability to process large volumes of samples quickly is essential.
In addition to improvements in sequencing chemistry and instrumentation, advancements in bioinformatics tools and data analysis pipelines are driving market growth by facilitating the interpretation and utilization of genomic data generated by short read sequencing platforms. As the volume and complexity of genomic data continue to increase, there is a growing need for sophisticated bioinformatics solutions that can handle large datasets, identify genetic variants, and extract meaningful insights. Companies are developing user-friendly bioinformatics platforms and software packages that enable researchers and clinicians to analyze, annotate, and interpret genomic data efficiently, thereby accelerating scientific discovery and clinical decision-making.
Key Market Challenges
Data Analysis Complexities
One of the primary challenges hindering the Global Short Read Sequencing Market is the complexity of data analysis. Generating large volumes of genomic data is only the first step; analyzing and interpreting this data present significant challenges. Short read sequencing produces vast amounts of raw sequencing data, which must be processed, aligned, and analyzed using sophisticated bioinformatics tools and algorithms. The complexity of genomic data, including repetitive sequences, structural variations, and sequencing errors, complicates data analysis and interpretation, requiring advanced computational techniques and expertise. Addressing this challenge requires ongoing investment in bioinformatics research and the development of user-friendly analysis tools to streamline data processing and enhance the accuracy and efficiency of genomic analysis.
Standardization of Protocols
Another key challenge facing the Global Short Read Sequencing Market is the lack of standardization of protocols and workflows. Different sequencing platforms, library preparation methods, and data analysis pipelines may produce varying results, making it difficult to compare data across studies or laboratories. Standardizing protocols for sample preparation, sequencing, and data analysis is essential to ensure reproducibility, reliability, and comparability of genomic data. Collaborative efforts between industry stakeholders, regulatory agencies, and research communities are needed to establish standardized protocols, guidelines, and quality control measures for short read sequencing technologies. Additionally, initiatives such as proficiency testing and external quality assessment programs can help validate sequencing protocols and ensure consistent performance across different platforms and laboratories.
Ethical Considerations and Data Privacy
Ethical considerations surrounding genomic data privacy and consent present significant challenges for the Global Short Read Sequencing Market. Genomic data contain sensitive information about individuals' genetic makeup, predispositions to diseases, and familial relationships, raising concerns about data privacy, security, and potential misuse. Ensuring informed consent, protecting patient confidentiality, and safeguarding genomic data from unauthorized access or disclosure are paramount. Regulatory frameworks and guidelines governing the collection, storage, and sharing of genomic data, such as the General Data Protection Regulation (GDPR) in Europe and the Health Insurance Portability and Accountability Act (HIPAA) in the United States, must be adhered to. Additionally, transparency in data handling practices, robust data encryption methods, and secure data storage infrastructure are essential to address ethical concerns and build trust among patients, researchers, and stakeholders in the short read sequencing market.
Key Market Trends
Advancements in Oncology Research
Advancements in oncology research are playing a significant role in boosting the Global Short Read Sequencing Market. Cancer, a complex genetic disease, presents unique challenges in diagnosis, treatment, and patient management. However, recent breakthroughs in oncology research, coupled with advancements in short read sequencing technologies, have revolutionized our understanding of cancer biology and treatment strategies. Short read sequencing technologies, also known as next-generation sequencing (NGS), have emerged as indispensable tools in oncology research. These platforms enable comprehensive genomic profiling of tumors, providing researchers and clinicians with valuable insights into the genetic alterations driving cancer initiation, progression, and treatment resistance. By sequencing the genomes of cancer cells, short read sequencing technologies can identify somatic mutations, copy number variations, and gene expression patterns associated with specific cancer types or subtypes.
One of the key ways in which advancements in oncology research are boosting the Global Short Read Sequencing Market is through the discovery of novel therapeutic targets. Genomic profiling of tumors using short read sequencing technologies has led to the identification of actionable mutations and molecular pathways that can be targeted with precision therapies. For example, the discovery of oncogenic driver mutations such as EGFR in non-small cell lung cancer (NSCLC) has paved the way for the development of targeted therapies such as tyrosine kinase inhibitors (TKIs), which have significantly improved outcomes for patients with EGFR-mutant NSCLC.
Moreover, advancements in oncology research have led to the development of novel biomarkers for predicting treatment response and prognosis. Short read sequencing technologies enable researchers to identify predictive biomarkers such as microsatellite instability (MSI) or tumor mutational burden (TMB), which can guide treatment decisions and help stratify patients based on their likelihood of response to therapy. Additionally, genomic profiling of tumors using short read sequencing can uncover mechanisms of treatment resistance, informing the development of new therapeutic strategies to overcome resistance and improve patient outcomes.
Furthermore, advancements in oncology research are driving the adoption of short read sequencing technologies in clinical diagnostics. Genomic profiling of tumors using short read sequencing can inform precision oncology approaches, enabling clinicians to tailor treatment regimens to individual patients based on their genomic profile. As precision medicine continues to gain traction in oncology, the demand for short read sequencing technologies in clinical diagnostics is expected to escalate, driving market growth and innovation.
Expansion of Applications in Non-Clinical Sectors
The Global Short Read Sequencing Market is witnessing a significant boost due to the expansion of applications in non-clinical sectors. While short read sequencing technologies have traditionally been associated with genomic research and clinical diagnostics, their versatility and scalability have opened up new opportunities in non-clinical fields such as agriculture, forensics, and environmental monitoring. In agriculture, short read sequencing is revolutionizing crop improvement, livestock breeding, and food safety testing. By sequencing the genomes of plants and animals, researchers can identify genetic variations associated with desirable traits such as yield, disease resistance, and nutritional content. This information is invaluable for breeding programs aimed at developing improved crop varieties and livestock breeds. Additionally, short read sequencing technologies enable rapid and accurate detection of pathogens and contaminants in food products, ensuring food safety and quality control.
In the field of forensics, short read sequencing is being used for DNA profiling and identification purposes. Short read sequencing technologies can analyze minute amounts of DNA from forensic samples such as hair, blood, or saliva, providing valuable genetic information for criminal investigations and identification of individuals. Moreover, short read sequencing enables the analysis of complex DNA mixtures and degraded samples, enhancing the accuracy and reliability of forensic analysis.
Furthermore, short read sequencing technologies are increasingly being applied in environmental monitoring and biodiversity conservation efforts. By sequencing environmental DNA (eDNA) from soil, water, or air samples, researchers can assess biodiversity, monitor ecosystem health, and detect invasive species or pathogens. Short read sequencing enables high-throughput analysis of eDNA samples, providing insights into microbial communities, species composition, and ecological interactions. This information is essential for conservation efforts, habitat restoration, and management of natural resources. The expansion of applications in non-clinical sectors is driving the demand for short read sequencing technologies and fueling market growth. As the versatility and scalability of short read sequencing platforms continue to improve, the adoption of these technologies in agriculture, forensics, and environmental monitoring is expected to accelerate further.
Segmental Insights
Product Insights
Based on the Product, the Consumables segment emerged as the dominant segment in the Global Short-Read Sequencing market in 2023. Consumables such as reagents, kits, and cartridges are essential components required for conducting short-read sequencing experiments. These consumables are consumed in large quantities during sample preparation, library construction, and sequencing reactions, making them indispensable for researchers and laboratories performing genomic analysis. The increasing adoption of short-read sequencing technologies across various applications, including genomics research, clinical diagnostics, and non-clinical sectors, has fueled the demand for consumables.
Application Insights
Based on the Application, targeted sequencing & resequencing segment emerged as the dominant segment in the Global Short-Read Sequencing market in 2023. Targeted sequencing allows for the identification of genetic variations, mutations, and biomarkers associated with specific diseases or conditions, enabling clinicians to tailor treatment strategies to individual patients based on their genomic profile. As precision medicine gains traction across various therapeutic areas, including oncology, rare diseases, and pharmacogenomics, the demand for targeted sequencing and resequencing technologies continues to rise.
Regional Insights
North America emerged as the dominant player in the Global Short-Read Sequencing Market in 2023, holding the largest market share. North America boasts a robust infrastructure for genomics research and development, with a concentration of leading academic institutions, research centers, and biotechnology companies driving innovation in the field of short-read sequencing. The region is home to prominent sequencing technology providers such as Illumina, Thermo Fisher Scientific, and Pacific Biosciences, who continue to spearhead advancements in sequencing platforms and applications. Also favorable government initiatives and funding support for genomics research and precision medicine initiatives have contributed to the dominance of North America in the global short-read sequencing market.
Key Market Players
• Illumina, Inc.
• Invitae Corporation
• Thermo Fisher Scientific, Inc.
• Pacific Biosciences of California, Inc.
• BGI Genomics Co., Ltd
• QIAGEN NV
• Agilent Technologies
• Azenta US, Inc. (GENEWIZ)
• PerkinElmer, Inc.
• ProPhase Labs, Inc. (Nebula Genomics)
Report Scope:
In this report, the Global Short-Read Sequencing Market has been segmented into the following categories, in addition to the industry trends which have also been detailed below:
• Global Short-Read Sequencing Market, By Product:
o Instruments
o Consumables
o Services
• Global Short-Read Sequencing Market, By Application:
o Whole Genome Sequencing
o Whole Exome Sequencing
o Targeted Sequencing & Resequencing
o Others
• Global Short-Read Sequencing Market, By End-User:
o Academic & Research Institutes
o Hospitals & Clinics
o Pharmaceutical & Biotechnology Companies
o Others
• Global Short-Read Sequencing Market, By Region:
o North America
 United States
 Canada
 Mexico
o Europe
 France
 United Kingdom
 Italy
 Germany
 Spain
o Asia-Pacific
 China
 India
 Japan
 Australia
 South Korea
o South America
 Brazil
 Argentina
 Colombia
o Middle East & Africa
 South Africa
 Saudi Arabia
 UAE
Competitive Landscape
Company Profiles: Detailed analysis of the major companies present in the Global Short-Read Sequencing Market.
Available Customizations:
Global Short-Read Sequencing Market report with the given market data, Tech Sci Research offers customizations according to a company's specific needs. The following customization options are available for the report:
Company Information
• Detailed analysis and profiling of additional market players (up to five).

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